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Institut Gustave Courbet
ORNANS 
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Maison du patrimoine et des forges
AUDINCOURT 
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Musée de la vie d'avant
ORNANS 
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Musée de la Tournerie
LAVANS-LES-SAINT-CLAUDE 
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Musée des salières
SELLIERES 
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Musée départemental des Sapeurs-Pompiers
GEX 
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Maison de l'absinthe
MÔTIERS 
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Maison de Pergaud
BELMONT 
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Musée de l'Espace des Mondes Polaires Paul-Émile Victor
PREMANON 
Musée
La maison du bois et de la forêt
MOUCHARD 
Musée
La fraternelle - Maison du Peuple
SAINT-CLAUDE 
Musée
Hôtel Particulier des Sires de Neufchâtel
BAUME-LES-DAMES 
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Musée de la Poterie Joseph Martin
ETREPIGNEY 
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ArchéoJuraSites
CHAUX-DES-CROTENAY 
Musée
Musée paléoécologique de Cerin
MARCHAMP 
Musée
Ecomusée Maison de Pays en Bresse
SAINT-ETIENNE-DU-BOIS 
Musée
Musée des traditions vigneronnes
VONGNES 
Musée
Fonds Régional d'Art Contemporain
BESANCON 
Musée
Musée de la mode du 18ème 19ème siècle
ORGELET 
Musée
Musée Relais du Cheval de Trait Comtois et de la Fôret
LEVIER 
Musée
Le Monde des Automates
SAINT-CLAUDE 
Musée
Musée de la mécanographie
BOURG-EN-BRESSE 
Musée
Musée de la vigne et du vin
LODS 
Musée
Coligny Car Museum
COLIGNY 