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Ecomusée les Vieux Clous
NEUVILLE-SUR-AIN 
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Musée de la Résistance et de la Déportation - Citadelle de Besançon
BESANCON 
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L'Ébauche
VILLERS-LE-LAC 
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Musée de la Cave de la Ville Haute
PAYS-DE-CLERVAL 
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Musée de la Pince
MONTECHEROUX 
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Le Monde des Automates
SAINT-CLAUDE 
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Apothicairerie de Poligny
POLIGNY 
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La Maison de la Haute Seille
CHATEAU-CHALON 
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Musée de la Boissellerie
BOIS-D'AMONT 
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MÔTIERS 
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Maison du Patrimoine
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Fromagerie-Musée
TREPOT 
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CLERON 
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Musée archéologique de Briord
BRIORD 
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Musée des traditions bugistes
SAINT-RAMBERT-EN-BUGEY 
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Musée Relais du Cheval de Trait Comtois et de la Fôret
LEVIER 
Musée
Musée de véhicules anciens
PERRIGNY 
Musée
Musée des pierres et du lapidaire
MIJOUX 
Musée
Musée du Ski et de la Tradition Rousselande
LES ROUSSES 
Musée
Maison du patrimoine et des forges
AUDINCOURT 
Musée
Le Hameau du Fromage
CLERON 
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Musée départemental des Sapeurs-Pompiers
GEX 
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Musée de la vie d'avant
ORNANS 
Musée
L'école d'autrefois
CHATEAU-CHALON 