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Musée des Beaux-Arts et d'Archéologie
BESANCON 
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Coligny Car Museum
COLIGNY 
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La maison du bois et de la forêt
MOUCHARD 
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Musée municipal d'Art et d'Histoire
PONTARLIER 
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Musée de la vie d'avant
ORNANS 
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La Forge du Moulin
MARIGNY 
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Ecomusée Les Outils d'Autrefois
ARINTHOD 
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Musée de L'Aventure Peugeot
SOCHAUX 
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Musée "Mémoires d'Autrefois"
AMBRONAY 
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Apothicairerie de Salins-les-Bains
SALINS-LES-BAINS 
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Musée des Beaux-Arts
LONS-LE-SAUNIER 
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Musée des pierres et du lapidaire
MIJOUX 
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Musée de la République du Saugeais - Abbaye de Montbenoît
PAYS-DE-MONTBENOIT 
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Musée de l'Espace des Mondes Polaires Paul-Émile Victor
PREMANON 
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Musée du Tacot
CLERON 
Musée
Maison du Patrimoine
REMORAY-BOUJEONS 
Musée
Ferme-musée du Montagnon
FOURNETS-LUISANS 
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Musée de véhicules anciens
PERRIGNY 
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Les Baraques du 14
LA VIEILLE-LOYE 
Musée
Musée de la Meunerie de Métabief
METABIEF 
Musée
Le Prieuré de Mouthier Haute-Pierre
MOUTHIER-HAUTE-PIERRE 
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Musée du Ski et de la Tradition Rousselande
LES ROUSSES 