Musée
Apothicairerie de l'hôpital d'Arbois
ARBOIS 
Musée
Le Pavillon des Sciences
MONTBELIARD 
Musée
Coligny Car Museum
COLIGNY 
Musée
Muséum – Citadelle de Besançon
BESANCON 
Musée
Musée de la Paysannerie et des Vieux Métiers
VALENTIGNEY 
Musée
Hôtel Particulier des Sires de Neufchâtel
BAUME-LES-DAMES 
Musée
Musée animalier
JOUGNE 
Musée
Musée de la Cave de la Ville Haute
PAYS-DE-CLERVAL 
Musée
Musée du Temps
BESANCON 
Musée
Musée du Peigne et de la Plasturgie
OYONNAX 
Musée
Musée de la Lunette
HAUTS DE BIENNE 
Musée
Musée des Maisons Comtoises
NANCRAY 
Musée
Musée de l'Abbaye / donations Guy Bardone - René Genis
SAINT-CLAUDE 
Musée
Musée Ledoux
ARC-ET-SENANS 
Musée
Musée du Bugey-Valromey
ARVIERE-EN-VALROMEY 
Musée
Musée du cheminot
AMBERIEU-EN-BUGEY 
Musée
Cuivrerie de Cerdon
CERDON 
Musée
Écomusée - Maison Michaud
CHAPELLE-DES-BOIS 
Musée
Musée Archéologique
CHAMPAGNOLE 
Musée
Isarnodurum - Musée archéologique
IZERNORE 
Musée
La Grande Saline de Salins-les-Bains
SALINS-LES-BAINS 
Musée
Musée du Ski et de la Tradition Rousselande
LES ROUSSES 
Musée
Musée de la mécanographie
BOURG-EN-BRESSE 
Musée
Musée minéralogique de la Grotte d'Osselle
ROSET-FLUANS 